1. 殺菌溫度與時間：
巴氏殺菌乳采用較低的殺菌溫度；超高溫滅菌乳采用135℃以上滅菌數秒。
2. 風味：
巴氏殺菌乳口味新鮮、接近于生鮮牛奶；超高溫滅菌乳有熟奶味或蒸煮味。
3. 營養：
巴氏殺菌乳營養破壞少；超高溫滅菌乳營養破壞多，主要是維生素等微量營養物質，但主要的營養成分如蛋白質、脂肪和乳糖等無大差異。
4. 保存條件和保質期：
巴氏殺菌乳在2—8℃下存放3—10天；超高溫滅菌乳常溫下可保存3—6個月，袋裝超高溫滅菌乳也可存放1.5個月。
5. 國外消費：
巴氏殺菌乳是主要消費類型；超高溫滅菌乳是次要或較少消費量。
巴氏殺菌奶的優點是：既可以殺死所有的致病菌，又較好地保存了牛奶的營養與天然風味。但殺菌后仍存在部分耐熱的細菌，因此要求在4℃左右的溫度下保存，且只能保存2—7天。超高溫滅菌奶是經過瞬時超高溫（135—140℃）滅菌處理，無菌包裝制成的牛奶，超高溫滅菌奶一般可以常溫保存6個月。
